Sporting Cristal, con su reciente coronación como campeón del torneo Clausura 2005 en Perú se convirtió en el segundo representante de ese país en la Copa Libertadores 2006.

Universitario de Deportes es el tercero gracias a que finalizó en la mejor ubicación del puntaje acumulado del año.

Es así que ambos conjuntos se unen a Cienciano del Cusco como los representantes peruanos en la Libertadores, donde la "U" jugará la primera fase eliminatoria.